Hingga hari kedua, Senin (16/9/2013), para pelajar DKI mampu mengumpulkan 6 medali emas, 2 perak dan 2 perunggu. DKI menambahkan 4 emas dan 2 perunggu dari hasil yang diperoleh pada hari pertama Minggu (15/9/2013).
Tambahan 4 medali emas DKI diperoleh dari Gagarin Nathaniel di nomor 50 meter gaya dada dengan catatan waktu 30.61 detik, Joanita Mutiara di 100 meter gaya bebas (1:01.12) serta dari estafet 4x100 metera gaya ganti putera dan puteri.
Di nomor estafet putera, DKI mencatat waktu 4:01.82 dan mengungguli Kaltim di posisi dua (4:08.64) serta Jatim (4:09.60). sementara di bagian puteri tim DKI mencatat 4:34.61, diikuti Jatim (4:36.47) dan Jabar (4:45.59).
Medali emas lainnya direbut atlet Sulawesi Selatan, Muh Hamgari di nomor 200 meter gaya kupu-kupu, Jennifer GT (Jabari) di bagian puteri serta Ahmad Mustaghfirin di nomor 100 meter gaya bebas dan Janice Tandokusumo di nomor 50 meter gaya dada.
Cabang renang Popnas XII akan berlangsung hingga Rabu (18/9/2013).
Berikut perolehan medali:
1. DKI Jakarta 6 2 2
2. Jawa Timur 2 4 5
3. Jawa Barat 2 2 5
4. Jawa tengah 2 1 2
5. Sulawesi Selatan 2 0 0
6. Kalimantan Timur 1 1 0
7. Banten 1 0 0
8. Bali 0 4 1
9. Riau 0 1 1
10. DI Yogyakarta 0 1 0